新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）感染症（COVID-19）は、流行の始まりから2年経過した現在も社会の脅威であり続けています。これに立ち向かうため、2020年5月に感染症学、ウイルス学、分子遺伝学、ゲノム医学、計算科学、遺伝統計学を含む、異分野の専門家が集まり、共同研究グループ「コロナ制圧タスクフォース」を立ち上げ、小川誠司 医学研究科教授もそのタスクフォースメンバーとなりました。コロナ対応の最前線に立つ医療従事者からも大きな賛同を得て全国100以上の病院が参加し、2022年7月末時点で6,000人以上の患者さんのご協力で、アジア最大の生体試料数を持つ研究グループへと発展しました。
コロナ制圧タスクフォースは、このCOVID-19患者検体のゲノム解析を進め、アジアで初めてCOVID-19患者さんと健常者との遺伝子型を網羅的に比較する大規模ゲノムワイド関連解析を実施しました。その結果、免疫機能での重要な役割が知られる「Dedicator of cytokinesis 2（DOCK2）」と呼ばれる遺伝子の領域の遺伝子多型（バリアント）が、65歳以下の非高齢者における重症化リスクと関連性を示すことを発見しました。また、RNA-seq解析、single cell RNA-seq解析一細胞解析、病理解析、細胞実験、動物実験による詳細な解析から、DOCK2がCOVID-19の重症化のマーカーとなるだけでなく、COVID-19の治療標的となることを見出しました。これらの成果は今後の新しい治療戦略につながると考えられます。
本研究成果は、2022年8月8日に、国際科学誌「Nature」オンライン版に掲載されました。コロナ制圧タスクフォースは、新型コロナウイルスと闘う患者さんや、医療従事者と共に、新型コロナウイルスの克服、そしてネクストパンデミックに備える社会の公器として、引き続き活動を続けていきます。
図（A）DOCK2リスクアリルを有する65歳未満のCOVID-19患者では、DOCK2発現量が有意に低下していた。（B）COVID-19が重症化するに従い、DOCK2発現量は低下していた。（C）single cell RNA-seq解析により、単球と樹状細胞を5つの細胞種に分類した。（D）DOCK2はCD14+CD16++単球において細胞種特異的に高発現であった。（E）COVID-19患者は健常者と比較して、特にCD14+CD16++単球においてDOCK2発現が低下していた。（F） CD14+CD16++単球において、DOCK2リスクアリルを有するCOVID-19患者では、DOCK2発現量が有意に低下していた。一方、健常者においては、同様の傾向を認めなかった。
【DOI】
https://doi.org/10.1038/s41586-022-05163-5
【KURENAIアクセスURL】
http://hdl.handle.net/2433/276335
【書誌情報】
Ho Namkoong, Ryuya Edahiro, Tomomi Takano, Hiroshi Nishihara, Yuya
Shirai, Kyuto Sonehara, Hiromu Tanaka, Shuhei Azekawa, Yohei Mikami, Ho
Lee, Takanori Hasegawa, Koji Okudela, Daisuke Okuzaki, Daisuke Motooka,
Masahiro Kanai, Tatsuhiko Naito, Kenichi Yamamoto, Qingbo S. Wang,
Ryunosuke Saiki, Rino Ishihara, Yuta Matsubara, Junko Hamamoto, Hiroyuki
Hayashi, Yukihiro Yoshimura, Natsuo Tachikawa, Emmy Yanagita, Takayoshi
Hyugaji, Eigo Shimizu, Kotoe Katayama, Yasuhiro Kato, Takayoshi Morita,
Kazuhisa Takahashi, Norihiro Harada, Toshio Naito, Makoto Hiki, Yasushi
Matsushita, Haruhi Takagi, Ryousuke Aoki, Ai Nakamura, Sonoko Harada,
Hitoshi Sasano, Hiroki Kabata, Katsunori Masaki, Hirofumi Kamata,
Shinnosuke Ikemura, Shotaro Chubachi, Satoshi Okamori, Hideki Terai,
Atsuho Morita, Takanori Asakura, Junichi Sasaki, Hiroshi Morisaki,
Yoshifumi Uwamino, Kosaku Nanki, Sho Uchida, Shunsuke Uno, Tomoyasu
Nishimura, Takashi Ishiguro, Taisuke Isono, Shun Shibata, Yuma Matsui,
Chiaki Hosoda, Kenji Takano, Takashi Nishida, Yoichi Kobayashi, Yotaro
Takaku, Noboru Takayanagi, Soichiro Ueda, Ai Tada, Masayoshi Miyawaki,
Masaomi Yamamoto, Eriko Yoshida, Reina Hayashi, Tomoki Nagasaka, Sawako
Arai, Yutaro Kaneko, Kana Sasaki, Etsuko Tagaya, Masatoshi Kawana, Ken
Arimura, Kunihiko Takahashi, Tatsuhiko Anzai, Satoshi Ito, Akifumi Endo,
Yuji Uchimura, Yasunari Miyazaki, Takayuki Honda, Tomoya Tateishi, Shuji
Tohda, Naoya Ichimura, Kazunari Sonobe, Chihiro Tani Sassa, Jun
Nakajima, Yasushi Nakano, Yukiko Nakajima, Ryusuke Anan, Ryosuke Arai,
Yuko Kurihara, Yuko Harada, Kazumi Nishio, Tetsuya Ueda, Masanori Azuma,
Ryuichi Saito, Toshikatsu Sado, Yoshimune Miyazaki, Ryuichi Sato, Yuki
Haruta, Tadao Nagasaki, Yoshinori Yasui, Yoshinori Hasegawa, Yoshikazu
Mutoh, Tomoki Kimura, Tomonori Sato, Reoto Takei, Satoshi Hagimoto,
Yoichiro Noguchi, Yasuhiko Yamano, Hajime Sasano, Sho Ota, Yasushi
Nakamori, Kazuhisa Yoshiya, Fukuki Saito, Tomoyuki Yoshihara, Daiki
Wada, Hiromu Iwamura, Syuji Kanayama, Shuhei Maruyama, Takashi
Yoshiyama, Ken Ohta, Hiroyuki Kokuto, Hideo Ogata, Yoshiaki Tanaka,
Kenichi Arakawa, Masafumi Shimoda, Takeshi Osawa, Hiroki Tateno, Isano
Hase, Shuichi Yoshida, Shoji Suzuki, Miki Kawada, Hirohisa Horinouchi,
Fumitake Saito, Keiko Mitamura, Masao Hagihara, Junichi Ochi, Tomoyuki
Uchida, Rie Baba, Daisuke Arai, Takayuki Ogura, Hidenori Takahashi,
Shigehiro Hagiwara, Genta Nagao, Shunichiro Konishi, Ichiro Nakachi,
Koji Murakami, Mitsuhiro Yamada, Hisatoshi Sugiura, Hirohito Sano,
Shuichiro Matsumoto, Nozomu Kimura, Yoshinao Ono, Hiroaki Baba, Yusuke
Suzuki, Sohei Nakayama, Keita Masuzawa, Shinichi Namba, Ken Suzuki, Yoko
Naito, Yu-Chen Liu, Ayako Takuwa, Fuminori Sugihara, James B. Wing,
Shuhei Sakakibara, Nobuyuki Hizawa, Takayuki Shiroyama, Satoru Miyawaki,
Yusuke Kawamura, Akiyoshi Nakayama, Hirotaka Matsuo, Yuichi Maeda,
Takuro Nii, Yoshimi Noda, Takayuki Niitsu, Yuichi Adachi, Takatoshi
Enomoto, Saori Amiya, Reina Hara, Yuta Yamaguchi, Teruaki Murakami,
Tomoki Kuge, Kinnosuke Matsumoto, Yuji Yamamoto, Makoto Yamamoto, Midori
Yoneda, Toshihiro Kishikawa, Shuhei Yamada, Shuhei Kawabata, Noriyuki
Kijima, Masatoshi Takagaki, Noah Sasa, Yuya Ueno, Motoyuki Suzuki,
Norihiko Takemoto, Hirotaka Eguchi, Takahito Fukusumi, Takao Imai,
Munehisa Fukushima, Haruhiko Kishima, Hidenori Inohara, Kazunori Tomono,
Kazuto Kato, Meiko Takahashi, Fumihiko Matsuda, Haruhiko Hirata, Yoshito
Takeda, Hidefumi Koh, Tadashi Manabe, Yohei Funatsu, Fumimaro Ito,
Takahiro Fukui, Keisuke Shinozuka, Sumiko Kohashi, Masatoshi Miyazaki,
Tomohisa Shoko, Mitsuaki Kojima, Tomohiro Adachi, Motonao Ishikawa,
Kenichiro Takahashi, Takashi Inoue, Toshiyuki Hirano, Keigo Kobayashi,
Hatsuyo Takaoka, Kazuyoshi Watanabe, Naoki Miyazawa, Yasuhiro Kimura,
Reiko Sado, Hideyasu Sugimoto, Akane Kamiya, Naota Kuwahara, Akiko
Fujiwara, Tomohiro Matsunaga, Yoko Sato, Takenori Okada, Yoshihiro
Hirai, Hidetoshi Kawashima, Atsuya Narita, Kazuki Niwa, Yoshiyuki
Sekikawa, Koichi Nishi, Masaru Nishitsuji, Mayuko Tani, Junya Suzuki,
Hiroki Nakatsumi, Takashi Ogura, Hideya Kitamura, Eri Hagiwara, Kota
Murohashi, Hiroko Okabayashi, Takao Mochimaru, Shigenari Nukaga, Ryosuke
Satomi, Yoshitaka Oyamada, Nobuaki Mori, Tomoya Baba, Yasutaka Fukui,
Mitsuru Odate, Shuko Mashimo, Yasushi Makino, Kazuma Yagi, Mizuha
Hashiguchi, Junko Kagyo, Tetsuya Shiomi, Satoshi Fuke, Hiroshi Saito,
Tomoya Tsuchida, Shigeki Fujitani, Mumon Takita, Daiki Morikawa, Toru
Yoshida, Takehiro Izumo, Minoru Inomata, Naoyuki Kuse, Nobuyasu Awano,
Mari Tone, Akihiro Ito, Yoshihiko Nakamura, Kota Hoshino, Junichi
Maruyama, Hiroyasu Ishikura, Tohru Takata, Toshio Odani, Masaru
Amishima, Takeshi Hattori, Yasuo Shichinohe, Takashi Kagaya, Toshiyuki
Kita, Kazuhide Ohta, Satoru Sakagami, Kiyoshi Koshida, Kentaro Hayashi,
Tetsuo Shimizu, Yutaka Kozu, Hisato Hiranuma, Yasuhiro Gon, Namiki
Izumi, Kaoru Nagata, Ken Ueda, Reiko Taki, Satoko Hanada, Kodai
Kawamura, Kazuya Ichikado, Kenta Nishiyama, Hiroyuki Muranaka, Kazunori
Nakamura, Naozumi Hashimoto, Keiko Wakahara, Sakamoto Koji, Norihito
Omote, Akira Ando, Nobuhiro Kodama, Yasunari Kaneyama, Shunsuke Maeda,
Takashige Kuraki, Takemasa Matsumoto, Koutaro Yokote, Taka-Aki Nakada,
Ryuzo Abe, Taku Oshima, Tadanaga Shimada, Masahiro Harada, Takeshi
Takahashi, Hiroshi Ono, Toshihiro Sakurai, Takayuki Shibusawa, Yoshifumi
Kimizuka, Akihiko Kawana, Tomoya Sano, Chie Watanabe, Ryohei Suematsu,
Hisako Sageshima, Ayumi Yoshifuji, Kazuto Ito, Saeko Takahashi, Kota
Ishioka, Morio Nakamura, Makoto Masuda, Aya Wakabayashi, Hiroki
Watanabe, Suguru Ueda, Masanori Nishikawa, Yusuke Chihara, Mayumi
Takeuchi, Keisuke Onoi, Jun Shinozuka, Atsushi Sueyoshi, Yoji Nagasaki,
Masaki Okamoto, Sayoko Ishihara, Masatoshi Shimo, Yoshihisa Tokunaga, Yu
Kusaka, Takehiko Ohba, Susumu Isogai, Aki Ogawa, Takuya Inoue, Satoru
Fukuyama, Yoshihiro Eriguchi, Akiko Yonekawa, Keiko Kan-o, Koichiro
Matsumoto, Kensuke Kanaoka, Shoichi Ihara, Kiyoshi Komuta, Yoshiaki
Inoue, Shigeru Chiba, Kunihiro Yamagata, Yuji Hiramatsu, Hirayasu Kai,
Koichiro Asano, Tsuyoshi Oguma, Yoko Ito, Satoru Hashimoto, Masaki
Yamasaki, Yu Kasamatsu, Yuko Komase, Naoya Hida, Takahiro Tsuburai, Baku
Oyama, Minoru Takada, Hidenori Kanda, Yuichiro Kitagawa, Tetsuya Fukuta,
Takahito Miyake, Shozo Yoshida, Shinji Ogura, Shinji Abe, Yuta Kono,
Yuki Togashi, Hiroyuki Takoi, Ryota Kikuchi, Shinichi Ogawa, Tomouki
Ogata, Shoichiro Ishihara, Arihiko Kanehiro, Shinji Ozaki, Yasuko
Fuchimoto, Sae Wada, Nobukazu Fujimoto, Kei Nishiyama, Mariko Terashima,
Satoru Beppu, Kosuke Yoshida, Osamu Narumoto, Hideaki Nagai, Nobuharu
Ooshima, Mitsuru Motegi, Akira Umeda, Kazuya Miyagawa, Hisato Shimada,
Mayu Endo, Yoshiyuki Ohira, Masafumi Watanabe, Sumito Inoue, Akira
Igarashi, Masamichi Sato, Hironori Sagara, Akihiko Tanaka, Shin Ohta,
Tomoyuki Kimura, Yoko Shibata, Yoshinori Tanino, Takefumi Nikaido,
Hiroyuki Minemura, Yuki Sato, Yuichiro Yamada, Takuya Hashino, Masato
Shinoki, Hajime Iwagoe, Hiroshi Takahashi, Kazuhiko Fujii, Hiroto Kishi,
Masayuki Kanai, Tomonori Imamura, Tatsuya Yamashita, Masakiyo Yatomi,
Toshitaka Maeno, Shinichi Hayashi, Mai Takahashi, Mizuki Kuramochi,
Isamu Kamimaki, Yoshiteru Tominaga, Tomoo Ishii, Mitsuyoshi Utsugi,
Akihiro Ono, Toru Tanaka, Takeru Kashiwada, Kazue Fujita, Yoshinobu
Saito, Masahiro Seike, Hiroko Watanabe, Hiroto Matsuse, Norio Kodaka,
Chihiro Nakano, Takeshi Oshio, Takatomo Hirouchi, Shohei Makino,
Moritoki Egi, The Biobank Japan Project, Yosuke Omae, Yasuhito Nannya,
Takafumi Ueno, Kazuhiko Katayama, Masumi Ai, Yoshinori Fukui, Atsushi
Kumanogoh, Toshiro Sato, Naoki Hasegawa, Katsushi Tokunaga, Makoto
Ishii, Ryuji Koike, Yuko Kitagawa, Akinori Kimura, Seiya Imoto, Satoru
Miyano, Seishi Ogawa, Takanori Kanai, Koichi Fukunaga, Yukinori Okada
(2022). DOCK2 is involved in the host genetics and biology of severe
COVID-19. Nature, 609(7928), 754-760.
