| 2年 |
3月 |
医用高分子研究センター廃止（10年時限） |
| |
6月 |
生体医療工学研究センター設置 |
| |
6月 |
留学生センター設置（国際交流センター廃止） |
| 3年 |
4月 |
大学院人間・環境学研究科設置 |
| |
4月 |
生態学研究センター設置 |
| |
4月 |
木材研究所を木質科学研究所と改称 |
| 4年 |
10月 |
総合人間学部設置 |
| 5年 |
3月 |
教養部廃止 |
| 6年 |
6月 |
高等教育教授システム開発センター設置 |
| 8年 |
3月 |
アフリカ地域研究センター廃止（10年時限） |
| |
4月 |
大学院エネルギー科学研究科設置 |
| |
4月 |
アフリカ地域研究資料センター設置 |
| |
4月 |
学生懇話室設置 |
| |
5月 |
原子エネルギー研究所とヘリオトロン核融合研究センターを統合しエネルギー理工学研究所に改組・転換 |
| 9年 |
4月 |
総合博物館設置 |
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4月 |
総合情報メディアセンター設置（情報処理教育センター廃止） |
| 10年 |
4月 |
大学院アジア・アフリカ地域研究研究科設置 |
| |
4月 |
大学院情報学研究科設置 |
| |
4月 |
胸部疾患研究所と生体医療工学研究センターを統合し再生医科学研究所に改組・転換 |
| 11年 |
4月 |
大学院生命科学研究科設置 |
| |
6月 |
学生懇話室をカウンセリングセンターに改組 |
| 12年 |
4月 |
超高層電波研究センターを宙空電波科学研究センターに改組 |
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11月 |
大学文書館設置 |
| 13年 |
4月 |
食糧科学研究所廃止（大学院農学研究科と統合） |
| |
4月 |
国際融合創造センター設置 |
| 14年 |
3月 |
大学情報収集・分析センター設置 |
| |
4月 |
大学院地球環境学舎・学堂設置 |
| |
4月 |
大型計算機センターと総合情報メディアセンターを統合し学術情報メディアセンターに改組・転換 |
| |
4月 |
低温物質科学研究センター設置 |
| |
4月 |
福井謙一記念研究センター設置 |
| 15年 |
4月 |
高等教育研究開発推進機構設置 |
| |
4月 |
高等教育研究開発推進センター設置 |
| |
4月 |
高等教育教授システム開発センター廃止 |
| |
4月 |
フィールド科学教育研究センター設置 |
| |
4月 |
農学研究科附属演習林廃止 |
| |
4月 |
体育指導センター廃止 |
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10月 |
医学部保健学科設置 |
| 16年 |
4月 |
国立大学法人京都大学設立 |
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|
法学研究科基礎法学専攻、公法専攻、民刑事専攻、政治学専攻を法政理論専攻、国際公共政策専攻（修士課程）、法曹養成専攻（修士課程、法科大学院）に改組 |
| |
4月 |
木質科学研究所と宙空電波科学研究センターを統合し生存圏研究所に改組・転換 |
| |
4月 |
東南アジア研究センターを廃止･転換し、東南アジア研究所附置 |
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4月 |
遺伝子実験施設廃止 |
| |
12月 |
大学情報収集・分析センター廃止 |
| 17年 |
4月 |
環境安全保健機構設置 |
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4月 |
国際イノベーション機構設置 |
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4月 |
国際交流推進機構設置 |
| |
4月 |
情報環境機構設置 |
| |
4月 |
図書館機構設置 |
| |
4月 |
留学生センターを国際交流センターに改組 |
| 18年 |
4月 |
大学院公共政策連携研究部・公共政策教育部設置 |
| |
4月 |
大学院経営管理研究部・経営管理教育部設置 |
| |
4月 |
地域研究統合情報センター設置 |
| |
4月 |
ナノメディシン融合教育ユニット設置 |
| |
4月 |
生存基盤科学研究ユニット設置 |
| |
7月 |
次世代開拓研究ユニット設置 |
| |
9月 |
女性研究者支援センター設置 |
| 19年 |
4月 |
こころの未来研究センター設置 |
| |
4月 |
先端医工学研究ユニット設置 |
| |
4月 |
生命科学系キャリアパス形成ユニット設置 |
| |
4月 |
医療技術短期大学部廃止 |
| |
7月 |
国際イノベーション機構廃止 |
| |
7月 |
産官学連携本部設置 |
| |
7月 |
国際融合創造センターを産官学連携センターに改組 |
| |
10月 |
物質－細胞統合システム拠点設置 |
| 20年 |
4月 |
野生動物研究センター設置 |
| |
4月 |
埋蔵文化財研究センター廃止 |
| |
4月 |
文化財総合研究センター設置 |
| |
4月 |
宇宙総合学研究ユニット設置 |
| |
10月 |
先端技術グローバルリーダー養成ユニット設置 |
| 21年 |
9月 |
次世代研究者育成センター設置 |
| 22年 |
3月 |
学際融合教育研究推進センター設置 |
| |
4月 |
iPS細胞研究所設置 |
| |
4月 |
産官学連携センター廃止（産官学連携本部に統合） |
| |
4月 |
ナノメディシン融合教育ユニット廃止 |
| |
4月 |
先端医工学研究ユニット廃止 |
| |
4月 |
生命科学系キャリアパス形成ユニット廃止 |
| 23年 |
4月 |
放射性同位元素総合センター廃止（環境安全保健機構に統合） |
| |
4月 |
環境保全センター廃止（環境安全保健機構に統合）
|
| |
4月 |
国際交流センター廃止（国際交流推進機構に統合） |
| |
4月 |
保健管理センター廃止（環境安全保健機構に統合）
|
| |
4月 |
生存基盤科学研究ユニット廃止 |
| |
4月 |
次世代開拓研究ユニット廃止 |
| 24年 |
4月 |
次世代研究者育成センターを白眉センターと改称 |
| 25年 |
4月 |
大学院総合生存学館設置 |
| |
4月 |
高等教育研究開発推進機構廃止 |
| |
4月 |
国際高等教育院設置 |
| |
4月 |
先端技術グローバルリーダー養成ユニット廃止 |
| |
4月 |
宇宙総合学研究ユニット廃止 |
| |
8月 |
カウンセリングセンター廃止 |
| |
8月 |
学生総合支援センター設置 |
| 26年 |
4月 |
女性研究者支援センター廃止 |
| |
4月 |
男女共同参画推進本部設置 |
| 27年 |
4月 |
研究連携基盤設置 |
| 28年 |
4月 |
低温物質科学研究センター廃止（環境安全保健機構に統合） |
| |
4月 |
国際交流推進機構廃止 |
| |
4月 |
国際戦略本部設置 |
| |
4月 |
高等研究院設置 |
| |
10月 |
再生医科学研究所とウイルス研究所を統合しウイルス・再生医科学研究所に改組 |
| 29年 |
1月 |
東南アジア研究所と地域研究統合情報センターを統合し東南アジア地域研究研究所に改組 |
| |
4月 |
物質−細胞統合システム拠点を高等研究院物質−細胞統合システム拠点に改組 |
| 30年 |
4月 |
放射線生物研究センター廃止（大学院生命科学研究科に統合） |
| |
4月 |
原子炉実験所を複合原子力科学研究所と改称 |
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4月 |
大学院横断教育プログラム推進センター設置 |
| |
10月 |
高等研究院ヒト生物学高等研究拠点設置 |
| 31年 |
4月 |
文化財総合研究センター廃止（文学研究科に統合） |
