（平成16年5月1日現在）
| 構内 | 15年度建物面積 (平方メートル) |
16年度建物面積 (平方メートル) |
|---|---|---|
| 共通教育推進部 | 19,573 | 22,229 |
| 附属図書館 | 14,011 | 12,861 |
| 文学研究科・文学部 | 18,128 | 17,760 |
| 教育学研究科・教育学部 | 5,689 | 5,582 |
| 法学研究科・法学部 | 22,969 | 26,885 |
| 経済学研究科・経済学部 | 8,158 | 8,139 |
| 理学研究科・理学部・生命科学研究科 | 77,850 | 83,583 |
| 医学研究科・医学部 | 73,614 | 72,588 |
| 医学部附属病院 | 118,579 | 107,216 |
| 薬学研究科・薬学部 | 16,514 | 17,089 |
| 工学研究科・工学部・エネルギー科学研究科・情報学研究科 | 206,654 | 195,648 |
| 農学研究科・農学部 | 52,076 | 50,497 |
| 農学研究科附属農場 | 5,316 | 5,343 |
| 人間・環境学研究科・総合人間学部 | 18,935 | 26,928 |
| アジア・アフリカ地域研究研究科 | 2,996 | 3,816 |
| 地球環境学堂・学舎 | 2,717 | 3,034 |
| 化学研究所 | 22,352 | 24,108 |
| 人文科学研究所 | 7,481 | 7,201 |
| 再生医科学研究所 | 14,114 | 13,504 |
| エネルギー理工学研究所 | 19,046 | 17,453 |
| 木質科学研究所 | 6,690 | 0 |
| 防災研究所 | 47,644 | 47,057 |
| 基礎物理学研究所 | 5,684 | 5,018 |
| ウイルス研究所 | 10,002 | 8,772 |
| 経済研究所 | 3,150 | 3,052 |
| 数理解析研究所 | 4,103 | 4,020 |
| 原子炉実験所 | 23,715 | 23,061 |
| 霊長類研究所 | 12,854 | 11,068 |
| 生存圏研究所 | 0 | 10,890 |
| 東南アジア研究所 | 0 | 5,526 |
| 東南アジア研究センター | 5,705 | 0 |
| 学術情報メディアセンター | 10,529 | 9,528 |
| 放射線生物研究センター | 2,650 | 2,509 |
| 宙空電波科学研究センター | 4,883 | 0 |
| 生態学研究センター | 4,751 | 4,645 |
| 放射性同位元素総合センター | 6,377 | 5,633 |
| 環境保全センター | 1,101 | 1,101 |
| 遺伝子実験施設 | 1,588 | 0 |
| 留学生センター | 1,361 | 1,281 |
| 高等教育研究開発推進センター | 509 | 762 |
| 総合博物館 | 13,263 | 12,298 |
| 国際融合創造センター | 1,210 | 1,410 |
| 低温物質科学研究センター | 1,652 | 1,611 |
| フィールド科学教育研究センター | 18,188 | 16,233 |
| 福井謙一記念研究センター | 2,588 | 2,493 |
| 保健管理センター | 1,383 | 1,285 |
| 埋蔵文化財研究センター | 778 | 728 |
| 医療技術短期大学部 | 9,190 | 9,487 |
| その他の管理施設 | 80,665 | 140,693 |
| 職員宿舎 | 25,241 | 40,575 |
| 計 | 1,042,306 | 1,092,200 |
※昨年度まで各棟にある設備室については、各部局の面積として計上していたが、 H16年度より「その他の管理施設」に含めて計上することとした。